ИИ-нейрослоп в ваших лентах инстаграмм, в отчетах ваших студентов, и вот теперь файналли - в ваших лекарствах! 💊 Команда Radical Numerics публикует новую модельку Omnii-1, что-то на стыке S2F и gLM, учится и на ДНК и на модальностях. По собственным бенчам во всем SOTA, но даже не везде они смогли сделать честные сравнения (например, AlphaGenome они не могли запускать т.к. коммерческая компания). И вот с этой Omnii-1 ребята делают дизайн бактериофага (точнее, кажется, оптимизацию ножек фага T7), проверяют in vitro после чего вводят пациенту с антибиотико-резистентной бактериальной инфекцией. Ни что за инфекция, ни даже каков был исход - не раскрывают в силу клинической тайны: To protect the patient's privacy, we are not disclosing details of their clinical course or outcomes, as even limited clinical information could make the patient identifiable. Буквально, может лечение и не закончилось успехом))) В общем пока это даже не статья. Звучит конечно многообещающе, хотя для прикладной биоинформатики гораздо ценнее будет вчерашний релиз пик-коллера MACS3 версии 3.1.0: с помощью Джейкоба Шрайбера (писал про него) ускорили работу в 40-60 раз! И в целом манускрипт MACS3 оказывается был вот только-только опубликован: Doherty P. et al., GPB, 2026. Нам тут кстати свежие Hi-C пришли, надо поставить выравниваться... пойду работать

Ребятки, наш дружный коллектив, исследующий мембраны и мембранные белки запустил игру-аркаду Don't Get Solubilised 🤩🥳🤩 В ней вы - мембранный белк по имени Mr Membrane Protein. Задача - выживать в липидном бислое, собирать молекулы и ионы, переносить их через мембрану и избегать веществ, которые могут нарушить твоё счастливое мембранное существование 👁 Главная угроза - это детергенты и другие молекулы, способные взаимодействовать с мембраной и мембранными белками. Если на персонаже накапливается слишком много врагов, он становится solubilised 👾 Так чтоdon't get solubilised и good luck! 🧕 https://pstansfeld.github.io/Dont-Get-Solubilised.html

Октябрь - начинается бешеная пора ретритов. Сегодня мы с Кариночкой ездили на ретрит нашего консорциума SFB NeuroStem который нам организовали в спа-отеле в прекрасном городке Мауербах под Веной 🏡 Помимо обычных докладов и постерных сессий Том, менеджер консорциума, заготовил нам крышесносное развлечение. Всех студентов разбили на команды, каждая команда получила случайный набор биологических методов (у нас был пэтч-кламп и рэбис-трейсинг), моделей (у нас был С.елеганс) и крейзи-предметов (у нас была древняя ДНК). На основные этого набора надо было на пустом листе бумаге собрать научный постер на любую тему ограниченную лишь рамками приличия (рамок не оказалось). Все пустились во все тяжкие и было великолепно и смешно 😆 Ну а завтра начинается четырехдневный ретрит моей лабы, и у меня есть эта ночь чтобы допилить презентацию к нему 🤪