Your access to Claude is on hold An organization you belong to has been paused because of unusual activity. You can request a review below. Заставляют пройти верификацию. Прошел с паспортом РФ (загран). Тут же забанили. А как у вас? П.С. Написал апил. Посмотрим.

Всем рекомендую серию семинаров, которую организует Кирилл Половников. На следующем семинаре выступит наш коллега Тимофей Лагунов - будет возможность обсудить последние новости из области физического моделирования укладки хроматина. -------------------------- Dear colleagues, Please join us for the next Biophysics Seminar with Timothy Lagunov (Institute of Cytology and Genetics, Siberian Branch of the Russian Academy of Sciences). November 2 2026, at 4:00 pm Moscow time (UTC+3) Join online: https://mit.zoom.us/my/polovnik This time, the seminar will also take place in person in Moscow, alongside the Zoom broadcast. If you’d like to attend in person, please get in touch with me. Lampbrush chromosomes offer new insights into the molecular mechanisms of genome folding Abstract: Genome organization involves loop extrusion, a process in which protein complexes fold DNA into loops. Existing models describe transcriptionally active RNA polymerases as moving barriers that restrict extrusion. We tested this framework in lampbrush chromosomes, giant chromosomes in growing oocytes with compact chromatin regions and long, actively transcribed loops. Analysis of spatial chromatin interactions revealed domains with boundaries associated with convergently transcribed genes. However, biophysical computer modeling showed that treating RNA polymerases as the principal extrusion barriers failed to reproduce the observed contact patterns. The best agreement emerged when cohesive cohesin, a protein complex that holds sister chromatids together, acted as the barrier while extruders efficiently bypassed RNA polymerases. In this model, transcription establishes domain boundaries indirectly by pushing cohesive cohesin toward gene ends. Efficient passage through densely transcribed regions also challenges models in which extruders continuously slide along DNA, suggesting that they may instead step across extended transcription loops. These findings reveal how transcription can organize chromatin through the redistribution of cohesin and provide new constraints on the molecular mechanism of genome folding. The talk will last approximately 45 minutes, followed by 15–20 minutes of questions and discussion. Please feel free to share this invitation with colleagues and students who might be interested. We look forward to seeing you next Monday! With best wishes, Kirill Polovnikov

Ещё одна интересная статья нашей группы вышла на этой неделе: https://link.springer.com/article/10.1186/s13073-026-01820-w В этой статье мы проанализировали два способа определить, нарушает ли вариант, обнаруженный у пациента (например, хромосомная перестройка) экспрессию генов в нейрональны клеках. Мы сравнили два подхода - классическая дифференциальная экспрессия vs аллель-специфичная экспрессия. Короткий вывод - дифференциальная экспрессия лучше подходит для большинства генов. Но аллель-специфичная экспрессия может "спасти" когда доступна только одна линия клеток (нет "выборки") или генотип - что часто случается для моногенных болезней. В качестве бонуса - рецепт того, как мы использовали base editors для того чтобы создать SNV, различающий аллели. Поздравляю Анну Хабарову, первого автора статьи, с замечательной работой, а также весь коллектив нашей группы, принявшей участие и Бразильских коллег, которые помогли с линиями ИПСК разных генотипов.